Jan Mintaraga dilahirkan di Jogjakarta dari suatu keluarga pencinta seni. Jan muda gemar menggambar sejak masa kecilnya dan sering diminta untuk menampilkan karya-karyanya di kelas. Tahun 1952, Jan muda beserta keluarganya pindah ke Jakarta.
Setelah Jan lulus dari sekolah menengah, ia kuliah di ASRI Jogjakarta dan kemudian diITB (Desain Interior), dimana keduanya tidak diselesaikan olehnya. Pada awal karirnya, Jan menciptakan berbagai macam komik seperti roman, silat, wayang dan sejarah. Jan akhirnya dikenal karena menciptakan komik superhero terkenal Kapten Halilintar dan Virgo.
Pada tanggal 14 Desember 1999, Jan berpulang.